Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms