Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms