Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dgcr6O35347 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dgcr6O35347 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dgcr6O35347 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dgcr6O35347 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms