Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkd2O35245 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms