Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms