Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gcm2O09102 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gcm2O09102 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gcm2O09102 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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