Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
U90926O08546 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
U90926O08546 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
U90926O08546 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms