Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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