Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2888K7N746 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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