Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm2056J3QQ02 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm2056J3QQ02 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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