Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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