Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BC024978J3QPC3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC024978J3QPC3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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BC024978J3QPC3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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BC024978J3QPC3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC024978J3QPC3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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