Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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