Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm21972J3QN38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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