Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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