Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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