Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm3336J3QMQ6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Gm3336J3QMQ6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm3336J3QMQ6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm3336J3QMQ6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm3336J3QMQ6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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