Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lipo1J3QME6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lipo1J3QME6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms