Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp408H7BX78 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms