Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29394H3BIW7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm29394H3BIW7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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