Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms