Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcf11G3X9Z4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms