Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3G3X939 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms