Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna9G3X8Z7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms