Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms