Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp32F8VPZ3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms