Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms