Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LctF8VPT3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LctF8VPT3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms