Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arid4aF8VPQ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms