Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h7bF8VPP8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zc3h7bF8VPP8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms