Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5160F8VPN3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms