Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms