Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5798F7BTS7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms