Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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