Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10378F6XQQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm10378F6XQQ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10378F6XQQ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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