Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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