Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms