Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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