Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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