Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms