Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms