Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms