Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Vmn1r238E9Q373 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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