Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Hectd4E9Q2E4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms