Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3095E9Q058 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3095E9Q058 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms