Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms