Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms