Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms