Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5478D3Z6R0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5478D3Z6R0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms