Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9630041A04RikD3Z3U4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
9630041A04RikD3Z3U4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms